大恩德根本上師在示現色身收攝徵兆之後，仍於2011年12月11日再履東方有情世界，將法身蓮足作最後的駐足，環顧其台灣根本道場「花蓮持明聖寺」，並於授受沐恩弟子們親近禮敬之後，於2011年12月24日啟程返回祖寺所在，原擬圓盡弟子孝道，隨侍上師身側，以應不時，惟適值悾憁之際，不得成行。2011年12月26日大恩德根本上師安住在甚深禪定而示
現圓寂，乃於2011年12月31日兼程趕往尼泊爾祖寺匍伏奔喪。
上師法體暫厝於藏經樓2樓，祖寺喇嘛們先修法3 天，弟子們則於2012年1月1日起於藏經樓3樓開始修法，並先後蒙恰達桑給多傑仁波切、初璽仁波切、敦珠仁波切、雪謙冉江仁波切、慈克秋林仁波切等住錫之各大寺院叢林蒞臨，於每整7 天輪流全日修法祈禱獻供，寺內108盞酥油晝夜不息至大恩德根本上師荼毘之後。
大恩德根本上師圓寂捨世之後的第一旬〈第7天〉至第四旬〈第28天〉，於法體暫厝所在上空，不時有甘露法雨降下，或似與弟子同泣，或在洗淨弟子們罪障，或垂愍無緣同體大悲法眾之福薄。
2012年2月7日第六旬〈第42天〉，大恩德根本上師法體暫移祖寺舊址，上午10時多，在晴空的西方天際之上，掛上多條拱形彩虹，並有條狀彩虹橫排於寺頂上空，於彩虹周側環繞哈達狀的排雲及蓮花狀之雲朵，彩虹與雲朵歷久不散。下午西方的無雲晴空呈現兩個太陽左右並列異相，並可目視〈當時均以攝影留存〉。當移靈之始，由山巔處隱約似有鳥鳴，由遠而近，由緩而速，不一會整山響起鳥鳴聲，如經上所云，迦陵頻伽等共命之鳥，出和雅音，欲令法音宣流，變化所作，直待聖者法體入寺方歇。當此之際，法王隨侍並引領信眾弟子等持香默禱，剎那間；意之所住，如入前所未有之境。
圓七期間；波塔〈大舍利佛塔所在〉及波卡拉〈係歐美人士知名度假聖地，遊客均搭小飛機抵達，為登賞「安納普娜山魚尾峰」之基地，〉附近之俗家弟子近 300 人，聯袂前來謁見大恩德根本上師，2月8日另有
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多個家鄉修行人，在閉關房外席地而坐，竟日修法，唱頌西方極樂願文，旋律時而空靈優美，時而如訴低鳴，時而莊嚴淒亮，態度真誠
虔敬，寺〈室〉內聞聲者見狀躡手躡腳於一旁同坐，或合十、或共鳴、或泣或如定狀，偕心有同感，莫不動容。另有希臘、俄羅斯弟子均聞訊前來奔喪瞻仰，美國、新加坡、香港、台灣等地弟子亦接續前來，與上師法體同在。大恩德根本上師法體在自然狀態暫厝供奉 49天，暫厝所在之四周房舍林地，始終飄散著一種天然妙香，如同溫暖的氣息，弟子等在法體之前禪坐或守靈，無一例外，均能有祥和的輕安，奇妙的體驗。
2012年2月14日〈第49天〉荼毘法會，雪謙冉江仁波切、慈克秋林仁波切、不丹國師頌訣仁波切、秋吉寧瑪仁波切、嘉揚瓊珠仁波切等共同主持火供儀式，是日陽光普照，當大恩德根本上師法體由暫厝經堂請出見天之時，由西方山頂盡頭到寺頂上方之天空，拉出幾道哈達狀或似吉祥結之排雲。荼毘當時，圓滿之太陽呈現極大及多層次的日暈，暈之外圍環繞彩虹，彩虹之外則有眾說紛紜的雲朵，不可名狀的徵象。而後，南方及東方的籃色天空，五爪雲龍、大鵬金次翅鳥、哈達、蓮花等雲朵接踵而來，所有在場之化機信眾及弟子或照相〈相片中出現法輪、明點及光圈〉、或攝影、或淒美孤獨的安坐，或以各自本尊和壇城為信心之所依，默默祈禱及供養，獲得上師不共之四種灌頂，並做了上師成佛時為不共弟子和疾速現證圓滿正道之祈願。
按密續記載決定成就證量四種徵象：無雲晴空、彩虹天空、日月爭輝、陽焰及光點等。大恩德根本上師於捨世至荼毘當日的歷程內，成就的外在徵象，為所有在場之無論是漢人弟子或西方各國弟子；所親眼目睹，無可爭議。至於內在及秘密的神變成就深意，將由其法嗣─嘉揚瓊珠貝瑪汪千法王及具德之寧瑪巴成就上師等；依弟子等之因緣，應機示現。
猶記得，大恩德根本上師於身上有其 3 位大恩上師的照片〈恰達桑給多傑仁波切、敦珠法王、頂果清欽哲法王〉，有時在與弟子談到其侍奉大恩上師，就取出照片置於頭頂之上，有時在與弟子緬懷大恩上師恩德時，就取出照片默禱，有時在與弟子談到修身法要時，就取出照片反覆觀看，每一時每一刻均不忘大恩上師。近5~6年，上師時常勉勵：「對佛法要加倍精進修持，要知道，人不能夠永遠都年輕。」。有時候喝茶當下，把正在喝的茶碗擱下來，感嘆：「空暇的時候不多了，不知甚麼時候，死神一到，再也找不到今天修法的機會，大家都很忙，大家都在修電視大圓滿。」。大恩德根本上師曾經幾次低喃：「剩下的日子不多了，剩下的日子不多了。」，因此弟子們都會為根本上師持誦長壽佛咒，祈求上師長命百歲，並做了請求上師長久住世、長轉法輪的祈願及供養。
雖然上師色身不在，但師徒關係，有超越生死輪迴的情感，有跨世相繫的緣份，上師端坐在我等頭上，是我等生生世世心之所向，上師恩德雖累生累劫，亦無所不在。願我等沐恩弟子依怙上師恩德，於此生得再迎大恩德根本上師，再沐法雨；與上師同在。於來世莫墜惡道，再依怙大恩德根本上師座下，共受蓮師不共法門的無上甘露。
僅存三依的老人 滇畢將辰 於花蓮持明聖寺 百日
2012-04-04
註：三依是謂：「身所依止之佛像壇城、語所依止之法本密續、意所依止之成就上師。」
